一条合格的食品冷冻干燥机果蔬加工生产线不仅要有质量可靠、自动化程度高、性能优良的设备，而且要求厂房车间面积与设备加工能力相适应，厂房平面布局按工艺流程要求布局合理，这对于合理按排生产，提高生产效率，生产出合格的产品起到非常重要的作用。一般情况下，建一条中等经济规模的冻干蔬菜生产线其设备的冻干面积应达到800m²，即需要4台冻干面积为200m²的冷冻干燥机组成。
生产车间按功能分为原料保鲜库、低温冷藏库、粗处理车间、精处理车间、冻干设备间、卸料间、暂存间、挑选间、金探筛选间、包装间、成品库等。各车间按功能和工艺流程应合理布局，精处理车间应设消毒洗盘区，装盘上料区。
冷冻干燥机设备间包括速冻库和食品冷冻干燥机设备，从速冻库和干燥的前半部分隔断分为加工间和机械间，机械间设配电室和监控室。后处理挑选区可分为两个区域，以便挑选不同产品也可设为一次选别和二次选别。在装箱间设包装材料间。
各个车间的人员进出口及物料进出口应合理设置。按卫生要求，精处理车间及挑选区人员进出口处设与车间相连的更衣卫生间，按卫生要求应设进口缓冲区，换鞋间，更衣间，卫生间,淋浴室，洗手消毒间，凤淋室，精处理车间入口处还应设雨靴消毒池。下料间挑选区，金探筛选间，成品库，温度要求小于等于15℃，因此应在合适的位置设置空调机房。按制冷规范要求，冷库，速冻库，冻干机的用冷需单独设制冷站。
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