冻干机的冷冻干燥终点判断方法和重要性，准确判断冻干的终点，不只可节省能源，更有利于样品的的最终含水量，提高样品质量，是工艺优化的重要步骤。冷冻干燥终点判断方法有如下4种：
1、压力检测法：在冻干机上配置电动中间阀，通过暂时隔离冷阱和干燥腔，测试干燥腔一段时间内压力是否变化来判断样品是否断续升华，以此来检测冻干终点。此法适用于小冻干腔的大量样品冻干时，常用于小型实验室类冻干机。
2、温度检测法：冻干过程是一个升华的过程，而升华是要吸收能量的，在冻干的第二阶段为了加快结合水的升华，通常会提高搁板的温度（常用20℃~40℃），当升华结束时，样品不再吸收能量，此时样品的温度会慢慢接近搁板温度，最后趋于一致。故在配置有样品温度检测探头的冻干机可通过检测温度来判断，而配置有冻干曲线软件的冻干机更可从电脑上直接观察。
3、称重法：有些冻干机配置比较高，可以采用称重系统来检测。称重系统可以直接连续测定样品在冻干过程中的重量变化，以此直接掌握冻干各过程的水分升华情况，精确确定冻干终点，非常适合制药行业进行产品质量控制。常用于中试及工业生产型冻干机。
4、卡尔费休检测法：有些冻干机可以在线不停机的情况下取样，这样可以通常卡尔费休检测仪来检测水分，此法检测精度高，可以精确控制水分的含水量，检测速度快；缺点是操作复杂，要求设备配置较高，常用于中试及工业生产型冻干机。
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