随着冻干技术的兴起与发展，真空冷冻干燥机（冻干机）因适用在中药材的新型加工及活性保鲜，也逐渐在中药材行业得到更广泛应用。
例如鹿茸具有补肾壮阳、益精髓、强筋骨、补气血、通督脉等功效，是珍贵的药材及保健佳品。传统的鹿茸加工方法易造成鹿茸内有效成分流失或破坏，还常常出现破皮、空头、酸败、焦化、腐败变质等缺陷。经过研究，而通过冻干机低温冷冻干燥加工的鹿茸，并与沸水煮炸、微波能和远红外烤箱烘烤等传统的鹿茸加工方法相比较。结果表明，冻干鹿茸可最大限度地保持鹿茸的活性营养成分，鹿茸的形、色、味基本保持不变。既保证了鹿茸质量，又大大缩短加工周期；既能规范化操作，又便于计算机控制技术指标。
近期天气降温快，冻干汤通过真空冷冻干燥机制作的冻干粥类、冻干
在制药行业，冻干机用于冻干生物制品、冻干疫苗、冻干抗生素等热
在速溶饮料中，通过冻干机获得的冻干咖啡更接近现磨咖啡的风味和
人参作为一种珍贵的滋补药材，有人参皂苷、多糖和氨基酸等的营养
熊胆作为传统中药材，含有牛磺熊去氧胆酸（TUDCA）、胆红素
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